Há cinco anos, bolhas que desafiavam a gravidade e possuíam poderes misteriosos choveram na Terra. Após uma enorme explosão, Tóquio tornou-se o ponto zero, com a cidade sendo envolvida por uma bolha gigantesca. O resultado do fenômeno chamado «Bubble Fall», a metrópole que antes era a capital do Japão ficou submersa num mar que desafiava a gravidade; o governo declarou a área como zona proibida e os residentes abandonaram-na. Crianças órfãs devido à Queda da Bolha, ocupam Tóquio, participando em perigosas batalhas de parkour em equipas pelos edifícios em ruínas. Hibiki, talentoso craque nesses jogos com a habilidade de saltar entre bolhas, afirma que consegue ouvir sons vindos da Torre de Tóquio. Determinado a descobrir os seus mistérios, ele parte em direcção à fonte, mas cai nas águas. Uma rapariga, a quem dá o apelido de Uta, salva-o. Mas Hibiki mal sabe que o aparecimento de Uta na sua vida revelará os segredos por trás do evento que mudou o mundo deles para sempre.